RÉSISTANCE : Ces bactéries qui contrôlent les ressources alimentaires
Cette équipe de biologistes du Helmholtz Centre for Infection Research (HZI) étudie les bactéries E. coli multirésistantes de l'intestin. Si la plupart des souches E. coli sont inoffensives, les infections à d’autres souches E. coli multirésistantes entraînent environ 800.000 décès dans le monde chaque année. En décryptant comment certaines souches bénéfiques sont capables d'inhiber la croissance des souches multirésistantes, en les privant de leurs nutriments essentiels, l’étude, publiée dans la revue Nature Communications, révèle aussi commet venir à bout de certains infections multirésistantes.
Le microbiome intestinal est essentiel à notre santé. Cette communauté de bactéries et de micro-organismes variés favorise la digestion et influence le métabolisme et le système immunitaire.
La bactérie E. coli est présente dans environ 90 % des intestins.
« C'est une bactérie bénéfique qui a trouvé sa niche alimentaire dans l'intestin et peut s'y installer durablement », explique l’auteur principal, le Dr Marie Wende, du HZI. « Hormis quelques souches pouvant provoquer des infections gastro-intestinales,
la plupart des souches d'E. coli présentes dans l'intestin sont inoffensives.
Cependant, si la bactérie E. coli pénètre dans la circulation sanguine, elle peut être dangereuse, car elle peut endommager des organes ou provoquer une septicémie ».
La plupart de ces infections peuvent être traitées efficacement par des antibiotiques, sauf si elles sont causées par des bactéries E. coli dites multirésistantes, résistantes à de nombreux antibiotiques.
Une régulation immunitaire microbienne intrinsèque
Une approche préventive visant à éliminer les bactéries résistantes de l'intestin avant l'apparition de complications répondrait donc à un énorme besoin.
L'étude décrypte pour l’exploiter la compétition des bactéries pour les ressources alimentaires intestinales. Les chercheurs ont ainsi soumis plus de 430 souches d'E. coli différentes, isolées à partir d'échantillons de selles de donneurs sains, à une compétition pour la nourriture en présence également d’une souche d'E. coli multirésistante. Le microbiote de souris stériles a été utilisé pour ces expériences, qui révèlent que :
- certaines souches sont capables d'inhiber fortement la croissance de la souche multirésistante en la privant de ses nutriments essentiels ;
- ces souches d'E. coli « régulatrices » se confirment capables de contenir la souche multirésistante d'E. coli dans les intestins des souris vivantes ;
- la souche la plus efficace contre la souche multirésistante la supprime in vitro, tout aussi efficacement.
- une combinaison des 3 souches d'E. coli les plus performantes combinée également à la bactérie intestinale Klebsiella oxytoca -également réputée comme efficace contre les souches nocives- testée contre un éventail plus large de souches d'E. coli multirésistantes apporte un effet protecteur encore renforcé ;
-
cette combinaison permet d’éliminer complètement les souches nocives multirésistantes.
Quelle implication ? Une combinaison de souches bactériennes spécifiquement sélectionnées peut éliminer, via cette concurrence alimentaire, des bactéries intestinales nocives multirésistantes. Il reste néanmoins à vérifier que de telles combinaisons a priori efficaces sont bien inoffensives pour l'Homme et si leur efficacité contre les agents pathogènes multirésistants est bien stable.
Sous réserve de validation, ces souches d'E. coli sélectionnées pourraient être utilisées à titre préventif ou thérapeutique, contre les souches d'E. coli multirésistantes, sous forme de probiotiques par exemple.
Source: Nature Communications 1 July, 2025 DOI: 10.1038/s41467-025-61327-7 Suppression of gut colonization by multidrug-resistant Escherichia coli clinical isolates through cooperative niche exclusion
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Cette actualité a été publiée le 24/08/2025 par
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